有些骨囊腫是先天因素導致，但沒有遺傳傾向；大多數骨囊腫後天因素引起，導致骨囊腫的原因也都與遺傳無關，也不具有遺傳性。
1.先天發育不良所致
在胚胎期發育不良，導致少量具有分泌功能的滑膜細胞進入骨內後，就會導致骨液聚集，這時就可能會形成骨囊腫，這與遺傳無關。
2.靜脈阻滯所致
靜脈阻滯，血流不暢，會讓髓腔內的壓力增高，液體滯留，這時也會出現骨囊腫，這也與遺傳無關。
3.外傷出血所致
生活中難免會有一些意外，如果不小心出現外傷，導致出血，治療不及時，可能會引起骨纖維化，出現囊性包膜，這時就會引發骨囊腫，這更與遺傳無關。
