蛛網膜囊腫倘若發生在中顱窩，會誘發偏癱、頭痛及癲癇等；其次，倘若出現在鞍上區，會誘發巨頭畸形及發育遲緩等。
1、中顱窩蛛網膜囊腫
蛛網膜囊腫位於中顱凹，那麼，所誘發臨牀表現包括癲癇、頭痛、偏癱等。也有一些患者，有可能因爲橋靜脈發生撕裂，從而引起中顱凹囊腫出血。
2、鞍上區蛛網膜囊腫
蛛網膜囊腫發生在鞍上區，那麼鞍上出現囊腫，通常會伴隨腦積水這種不良症狀，引起主要表現包括顱內壓增高及巨頭畸形，發育遲緩及視力下降，還包括性早熟及搖頭玩偶綜合徵等。
3、後顱窩蛛網膜囊腫
若蛛網膜囊腫出現在後顱窩，那麼彌散性幕上，或發生幕下囊腫，通常都會伴隨腦積水，所誘發的表現包括顱內壓增高及巨頭畸形，還有發育遲緩等。
