病毒性腦炎常見後遺症包括：運動障礙、智力障礙、語言障礙、癲癇等。
1、運動障礙
病毒性腦炎屬於中樞神經系統感染性疾病，會影響患者正常肢體運動功能，上肢或下肢活動受限，運動障礙明顯，嚴重時會誘發偏癱。
2、智力障礙
病毒性腦炎以持續性高熱爲主，體溫一般在38.5℃以上，體溫持續性過高會導致腦細胞受損而影響智力。將近有17%左右病毒性腦炎患者患病後智力受到影響，智力障礙較爲嚴重。
3、語言障礙
病毒性腦炎屬於少罕見的壞死性炎症，當炎症波及大腦語言中樞，會造成不同程度語言障礙，有些患者表現爲語言含糊不清、說話困難、說話斷續等。
4、癲癇
病毒性腦炎，侵犯到大腦局部神經組織會誘發大腦神經異常放電而誘發癲癇。
