單純皰疹病毒可能導致胎兒流產、胎停、發育畸形、患先天性皰疹病毒感染性疾病等，具體影響與懷孕時間有關。
懷孕早期正是胎兒分化的關鍵期，如孕婦感染單純皰疹病毒，病毒會影響胚胎髮育，導致胎兒出現先天性發育畸形，如脣齶裂、先天性心臟病、無腦兒等。還可能會導致胎停、自然流產等。
懷孕中期感染單純皰疹病毒對胎兒的影響與疾病類型有關，如孕婦感染一型皰疹病毒，注意補充營養，適當鍛鍊身體，增強抵抗力，可自行消除病症，一般對胎兒發育影響不大。如感染二型生殖器皰疹，有可能會影響胎兒發育，導致胎兒發育畸形。
在懷孕後期感染單純皰疹病毒時，病毒經胎盤進入胎兒體內，可能引起先天性皰疹病毒感染。病毒還會經產道分娩時進入新生兒體內，導致新生兒出現腦炎等疾病，嚴重時還可能導致死亡。臨牀數據顯示，孕期感染單純皰疹病毒後，胎兒死亡率能達到70%-80%。
