卵巢巧克力囊腫對女性會造成嚴重的危害和影響，瞭解卵巢巧克力囊腫的原因對女性來說可以讓女性更加了解卵巢巧克力囊腫，讓卵巢巧克力囊腫治療得更快更好。
造成卵巢巧克力囊腫的原因有以下五種：
1、內分泌因素
內分泌是常見的卵巢囊腫的病因，卵巢雖小，卻是產生卵子並排卵、內分泌激素、平衡內分泌的重要器官，多發生於內分泌旺盛的生育年齡。所以認爲與內分泌失調有關。另外，來例假時生氣，一生氣例假就沒了，造成垃圾排不出來，在卵巢裏形成了囊腫。
2、分娩、多次流產等
卵巢巧克力囊腫主要是由於月經期子宮壁脫落的子宮內膜碎片因引流不暢，不能全部從陰道排出，有少量經輸卵管向盆腔倒流。凡是能影響月經血從陰道流出的，包括陰道閉鎖、子宮頸口狹小、子宮後傾、多次人工流產後子宮頸口粘連、月經期性生活等，都能促發生巧克力囊腫。
3、輸卵管阻塞
每月卵巢內沒有受精的卵泡成爲廢品垃圾也要排泄出去，必須靠體內液壓把這些垃圾擠出來，由於你機能減退，加上輸卵管有堵塞現象，垃圾排不出來，排不出去的卵子堆積在卵巢內，就形成了巧克力囊腫。
4、性生活頻繁
女性性生活頻繁也是導致卵巢巧克力囊腫的重要原因，一般發病多在青春期少女或更期婦女，這與她們頻繁性生活有很大關係。
5、生理原因
女性的子宮內膜在正常的情況下面是在宮腔之中生長的，隨着每個月女性生理期的到來，其會剝落之後重新開始增厚生長。但是由於內膜開始在女性的卵巢進行生長，但是在生理期的時候這一部分的內膜並不會隨着離開自己的，而是在卵巢的位置淤積，隨着長在卵巢位置的內膜不斷增厚，淤積的內膜會越來越多，使得卵巢的位置出現了囊腫。
