由於視網膜和葡萄膜中黑色素含量高，與某些藥物結合力高，特別是長期大量用藥時，容易受損，嚴重影響健康。然而，藥物對眼睛的損害並沒有引起人們的注意。
上瞼下垂的一些藥物可以阻斷交感神經，如巴比妥、氯喹、胍乙啶、溴銨、苯妥英鈉等；其他藥物，如長春新鹼，會導致眼外肌麻痹；有些藥物，如青黴胺，會導致嚴重的肌肉無力。因此，它們都會導致上瞼下垂。
近視和遠視毛果芸香鹼、毒扁豆鹼、新斯明可收縮睫狀肌，放鬆懸韌帶，突出晶狀體，形成痙攣和近視調節。阿托品、後馬託品、苯海拉明、非那根、撲爾敏、敏可靜、丙咪嗪、阿密替林等。，可以放鬆睫狀肌，緊張懸韌帶，扁平晶狀體，形成調節癱瘓和遠視。此外，鏈黴素和氯黴素可引起過敏性視神經炎，降低眼睛的近視和遠視。如果炎症不及時控制，會對視力造成很大的損害。
複視可發生在安定、苯巴比妥、苯妥英鈉、撲厥酮、卡馬西平、阿托品、丙咪嗪、消炎痛、呋喃妥因、長春新鹼等長期廣泛應用中，但停藥後複視可消失。
有些藥物對眼結膜有刺激作用。如磺胺醋酰鈉、可卡因、硼酸等，以及全身使用的利血平、洋地黃等都會引起刺激性結膜炎。有些藥物對結膜過敏，如氯黴素、金黴素、新黴素、慶大黴素、腎上腺素等眼科藥物，以及抗生素、磺胺、巴比妥、水合氯醛、保泰鬆等，可誘發過敏性結膜炎。需要指出的是，部分患者注射青黴素後，短至1~2天，長至1周以上，睜不開眼睛、異物感，需要及時治療。
角膜炎和角膜濁度角膜是指黑眼前的透明薄膜。可卡因、丁卡因等局部麻醉劑反覆滴入眼睛或長期使用皰疹，可引起過敏性或中毒性角膜炎。氯喹、氯丙嗪、抗炎疼痛（消炎痛）、乙胺碘呋酮和維生素D的長期應用會產生角膜濁度等副作用。
青光眼身或局部使用皮質激素，青光眼都可能導致眼壓升高，這與遺傳有關。此外，阿密替林也可能導致急性青光眼。
晶狀體濁度和白內障氯丙嗪、三氟拉嗪、白消安、卡馬西平、甲硫達嗪可導致晶狀體濁度。腎上腺皮質激素的長期或大量使用會導致晶狀體濁度和白內障。即使是治療青光眼的毛果芸鹼和毒扁豆鹼滴眼液也能促進晶狀體濁度，形成白內障。
氯黴素長期廣泛應用於視神經萎縮，可導致視神經萎縮，降低視力，削弱視力。異煙肼每天200~900毫克，10-2個月也可發生視神經萎縮。
眼球震顫是指眼球不由自主地擺動或跳動。安定、利眠寧、巴比妥、鏈黴素、多粘菌素、苯妥英鈉、卡馬西等藥物的大劑量應用可引起此病；除苯巴比妥引起眼球垂直跳動外，其他藥物均引起眼球水平擺動。停藥後，眼球震顫可以消失。
動眼危象是指兩隻眼睛突然無法控制地向上翻，伴有頸肩顫動。這種反應是由止吐藥滅吐精神和抗精神病藥物奮乃靜和三氟拉嗪引起的。
氯喹長期使用視覺和色覺障礙，眼前會出現霧濛濛的一片，這叫霧視。但是看燈光的時候，它周圍有一個彩環，像虹一樣，叫虹視。抗癲癇藥物三甲雙酮的應用，在明亮的光線下視力模糊，看起來一層雪，稱爲晝盲。過量使用洋地黃時，大多數患者視力朦朧，看到物體有閃光點和黃、紅、綠的光輝。當口服抗菌萘啶酸過多時，藍色或紫色，甚至黑色（這被稱爲黑眼蒙），短半小時，長到7小時消失。這些都是藥物直接作用於視網膜細胞的結果。
需要強調的是，維生素A通常是一種對眼睛有益的藥物，但長期大量使用會適得其反。如果出現複視、怕光、眼球震顫，嚴重時會引起視網膜出血和眼球突出，甚至眉毛和睫毛也會脫落。此外，聯合用藥不當也會影響眼睛。例如，異煙肼與抗結核藥物利血平和乙胺丁醇的結合會使眼睛腫脹，有異物感，害怕光線、眼淚和視力模糊。
