瀰漫性食管痙攣應與噴門鬆弛、瀰漫性食管痙攣、胃食管逆流疾病和食管神經症鑑別。
主要根據食管測壓檢查進行鑑別。
1.瀰漫性食管痙攣胡桃夾食管
此病與瀰漫性食管痙攣同屬原發性食管運動障礙性疾病，有報道稱本病是瀰漫性食管痙攣的先兆，鑑別困難。Benjamin等（1979）研究發現，本病高振幅收縮多在食管下段，同時伴有正常原發性食管蠕動。這是瀰漫性食管痙攣和桃夾食管的主要鑑別點。
2.胃食管反流症
胃食管反流患者也有食管動力異常的情況，表現爲假性管樣品。Achen等(1993)報道，從402例非心源性胸痛患者中檢測出40例(10%)核桃食管患者，胃鏡證明40例胡桃食管患者中有糜爛性食管炎1例(2.5%)，其中20例進行24小時食管pH監測，13例(65%)有異常量的酸反流。測壓檢測12例（30%）核桃夾食管患者胃食管反流。對這12例患者進行大量雷尼替丁或奧美拉唑積極抗酸治療8周後，7例(64%)患者核桃夾食管診斷特徵消失，2例(33%)食管動力正常。因此，我認爲這些患者看到的食管動力異常是胃食管逆流。堅持用解痙劑治療瀰漫性食管痙攣和非心源性胸痛前，應先排除胃食管反流病。
3.噴門下垂緩慢
噴門下垂緩慢噴門痙攣症也可以表現爲嚥下困難、胸骨後疼痛和飲食。食管鋇劑造影顯示，食管極度擴張、延長和迂迴，擴張下段呈鳥嘴狀狹窄的食管測壓顯示，食管下2/3段沒有蠕動波，高LES壓力伴有鬆動不良或完全鬆動。胡桃食管的特點是食管具有高振幅，達到150~200mmHg，長時間(>60s)蠕動性收縮，但食管LES功能正常，飲食時可放鬆。
