腦幹損傷是經常會伴有後遺症的，但是腦損傷後遺症一般都是因人而異，所以，在治療上也都是採取專病專治的方法，是根據病情來制定治療方案的。
1、在腦幹損傷後遺症治療期間，患者可以採取鍼灸的治療方式，再配合中頻電刺激，可以達到很好的效果。
2、進行康復性訓練，鍛鍊肢體擺放，進行關節的主動與被動活動，從大關節至小關節，動作逐漸加大。患者還可以採用助力訓練的方式，進行翻身、坐立訓練。
3、對於輕度的腦幹損傷後遺症，可以採用下樓梯的訓練方式。此訓練能夠鍛鍊平衡感，還可以活動關節，提升關節的活動度。
4、腦損傷後遺症患者的飲食要管理好，不可過飢或過飽，避免暴飲暴食，否則會加重腦損傷後遺症。要攝入足夠的營養，並且營養要全面均衡。
腦幹損傷後遺症的康復訓練必須要進行，根據患者的病情，制定康復訓練計劃，患者要積極的配合家屬和醫生。這對於患者腦幹損傷後遺症，有很好的恢復效果。
