雖然對於羊膜帶綜合徵的具體病因並不是非常清楚，但是有很多關於這種疾病的說法。所以這些說法一般都猜測，但也是有一定根據的，具體會有哪些假說呢？
1、外因論，在妊娠的早期，因爲不明原因使羊膜發生破裂但是絨毛膜是完整的。胎兒會通過羊膜破裂的地方到絨毛膜腔中，因爲絨毛膜的滲透性比較好，如果羊水外滲就可能導致羊水過少，這樣胎兒就會和絨毛膜比較貼近，絨毛膜還具體浸潤以及增生的能力，這樣就可能會破壞與胎兒組織接觸的部位，使這些地方出現畸形。
2、在妊娠的中期晚期時，如果出現胎膜破裂的情況時，一般是不會出現羊膜帶綜合徵。有些患者在妊娠的晚期進行羊膜腔穿刺，這時羊膜上會留下破孔，但是也不會出現羊膜帶綜合徵。
3、內因論，雖然在出現羊膜帶綜合徵和羊膜帶走一定關係，但是目前也沒有發現因爲羊膜帶造成的胎兒截肢或者是畸形，因此有些學者就會認爲羊膜帶綜合徵出現可能是因爲遺傳物質異常，也就是有些遺傳物質缺乏所致。
4、血管論，出現羊膜帶綜合徵時還會有合併複雜的內臟畸形。這些複雜的內臟畸形也不能單靠羊膜帶綜合徵來進行解釋，所以羊膜帶綜合徵出現可能會和血管中的活性物質有關。
