喉嚨交替性疼痛可能因患有慢性咽炎、扁桃體炎症引起，根據炎症類型可給予相應藥物治療，如碘含片、西瓜霜含片、阿莫西林、頭孢克洛等。
屬於咽部粘膜、粘膜下及淋巴組織的慢性炎症，當炎症不停刺激咽喉粘膜後，可造成咽喉部反覆性疼痛，並出現咽喉部交替性疼痛、反覆咽喉異物感、刺激性咳嗽等症狀。
治療上首先需改善不良日常習慣，如戒除研究、避免長期接觸粉塵、有害氣體等，其次需在專業醫生指導下，應用複方硼砂溶液清洗口腔、口咽，或含服西瓜霜含片、碘含片藥物治療。
是由致病微生物引起的感染性疾病，當細菌感染至雙側扁桃體，可出現雙側扁桃體紅腫、交替性疼痛，且疼痛較爲劇烈，或伴隨發燒等症狀。一般對於感染性扁桃體炎症，最好接受抗生素治療，臨牀常用抗生素包括阿莫西林、頭孢克洛、潑尼鬆片等。
