血尿爲膀胱癌的重要症狀，其鑑別診斷主要是血尿的鑑別。腎、輸尿管腫瘤與膀胱腫瘤的血尿相似，均可爲間歇性、無痛性血尿，但膀胱腫瘤90％單獨存在，膀胱腫瘤血尿可能伴有尿路刺激症狀或影響排尿。
1.腎、輸尿管腫瘤 與膀胱腫瘤的血尿相似，均可爲間歇性、無痛性血尿，但膀胱腫瘤90％單獨存在，膀胱腫瘤血尿可能伴有尿路刺激症狀或影響排尿，血尿開始或終末加重，可能有血塊或壞死組織。腎、輸尿管腫瘤無膀胱刺激症狀。一般經過B超、CT 掃描、MRI掃描、尿路造影檢查不難鑑別。
2.腎結核、膀胱結核 血尿在長期尿頻以後出現，終末加重，尿量少。可伴盜汗、消瘦等結核病的症狀。尿常規檢查可能查到結核病菌。膀胱內的結核性肉芽腫有時可能誤診爲膀胱腫瘤。但經組織活檢可以確診。
3.非特異性膀胱炎 多數爲已婚女性，血尿突然發生，可伴膀胱刺激症狀，尿頻、尿急、尿痛。血尿往往在膀胱刺激症狀以後或同時出現。非特異性膀胱炎偶可見到無痛全程血尿。尿中可有細菌。
4.腺性膀胱炎 臨牀表現與膀胱腫瘤相似，需經膀胱鏡檢查及活組織檢查鑑別。尿細胞學和腫瘤標誌物檢查也有助於鑑別。
5.尿路結石 血尿多爲鏡下血尿，上尿路結石可出現腎、輸尿管絞痛，膀胱結石可出現排尿中斷現象，通過腹部X線平片、B 超、膀胱鏡檢查等鑑別，由於膀胱結石對局部黏膜的刺激，可導致腫瘤發生。因此，長期膀胱結石出現血尿時，應想到膀胱癌的可能，必要時行膀胱鏡檢查及活檢。
6.放射性膀胱炎 盆腔臟器如子宮、卵巢、直腸、前列腺、精囊等腫瘤放療後可引起放射性膀胱炎，一般在放射治療同時或2 年以內出現，可以有血尿、膀胱刺激症狀，偶亦可見到治療後10～30年出現無痛血尿，膀胱鏡檢查可見黏膜放射性毛細血管擴張，有時出現潰瘍和肉芽腫。應用膀胱鏡等檢查可以鑑別。
7.前列腺增生 由於前列腺增生後造成排尿不暢或繼發感染，可出現與膀胱癌相似的症狀。經過細胞學檢查或膀胱鏡檢查可以確診。
8.前列腺癌 前列腺癌侵入膀胱可出現尿血、排尿困難等症狀，經B超、CT掃描、MRI掃描以及直腸指診可以明確診斷。
