器質性陽痿是指由身體的某些疾病引起的陽痿。引起陽痿的疾病有生殖器官的先天畸形及局部病變、血液病、神經系統疾患、內分泌系統疾病、外傷和手術後、全身疾患等。
器質性陽痿不管原因是什麼，都有以下的共同特點：①不分時間、地點，也不分性交或手淫，陰莖都不能勃起。②睡夢中陰莖即使偶然勃起，也疲軟無力。③性的慾望及性的要求強烈。
這類陽痿患者，應當注意對身體原有疾病的診斷和治療，但也不應忽略對陽痿的診斷和治療。必須先治原病；病治好後，再進行陽痿的治療才能取得更好的效果。
林先生，25歲，在東莞當小老闆。自結婚後，他就一直無法跟妻子過性生活。他不僅去看過男性專科，還去看過心理專科，藥吃了不少，可總是沒有效果。後做了頭部磁共振和內分泌的檢查，結果發現他的顱內鞍區長了一個3cm的腫瘤（通常稱爲顱咽管瘤），從而導致了他的陽痿。隨後，做了顯微鏡下切除腫瘤手術。性功能雖然沒有因此而立即恢復，但經過一段時間的激素替代治療，他逐漸恢復了性功能。
