重症肌無力的藥物治療主要包括：
(1）抗膽鹼酯酶藥物：作用機制在於抑制膽鹼酯酶的活性，而使終板有足夠的乙酰膽鹼，從而有利於神經衝動傳遞，使症狀獲改善。其劑量、服藥次數、時間依患者年齡、病情而有差異。宜從小劑量開始，直到調整至滿意劑量。
(2)腎上腺皮質激素：其治療機制與抑制機體自身免疫反應及糾正以胸腺爲主要環節的免疫病理學有關。一般使用於對抗膽鹼酯酶藥物療效欠佳的各型患者。對胸腺手術前使用該項治療爲患者安全渡過手術期並鞏固療效創造有利條件，也可用於術後的維持治療。一般選用潑尼鬆或潑尼鬆龍製劑口服。爲防止治療後一過性加重，以住院治療爲宜。
(3)其他免疫抑制劑或免疫調節劑：多用於對激素治療療效欠佳或對激素過敏及存在禁忌證，而不能接受該項治療者，可單用或與激素治療並用。這類藥可抑制免疫活性細胞的分化及增殖，對體液及細胞免疫均有作用。在使用過程中應密切觀察血象及血小板計數，若出現骨髓抑制現象，可予相應處理，必要時停用。
