引起急性腸炎的原因有生理性和病理性之分，生理性的原因主要就是飲食不當以及濫用藥物。病理性的原因以病毒感染和細菌感染最爲常見，也有部分患者是由於寄生蟲感染所致。除此之外，如果患有其他的腸道疾病，使得腸道功能失調，也容易引發急性腸炎。
一、生理性原因
1.飲食不當：急性腸炎的發病和飲食不當有着比較密切的關係，比如說吃了已經腐壞變質的食物或者被污染的食物，在日常的飲食過程中誤食含有刺激性化學物質的食物等腸道發生變態反應，從而患上急性腸炎。
2.濫用藥物：濫用藥物也是導致急性腸炎發病的常見原因之一。如果說用藥不當，藥物進入到腸道當中之後就會對腸道粘膜造成刺激和損傷，久而久之腸道內的菌羣就會失調，等到腸道免疫力下降之後，稍微不注意，就會受到各種病菌的感染，從而誘發急性腸炎。
二、病理性原因
1.病毒感染：病毒感染是導致急性腸炎的病理性因素之一，比較常見的病毒有貓科冠狀病毒或者犬瘟熱病毒。如果是嬰兒患上急性腸炎，很有可能是輪狀病毒感染所致。
2.細菌感染：細菌感染也容易誘發急性腸炎，比較常見的就是大腸桿菌、空腸彎曲桿菌等細菌，這些都是生活當中很常見的致病菌，如果平時不注意個人衛生，患上細菌性急性腸炎的機率會大大地增加。
3.寄生蟲感染：急性腸炎也有可能是寄生蟲感染所致，比較常見的寄生蟲就是蛔蟲和弓形蟲，小孩子容易被阿米巴蟲所感染，危害性很大，需要及時進行治療，以免引起併發症。
4.其他腸道疾病：其他的一些腸道疾病也容易引起急性腸炎，比如說潰瘍性結腸炎、腸易激綜合徵、結腸癌、直腸癌等。這些疾病很容易導致胃腸道功能失調，從而誘發急性腸炎。
