具有生長功能的子宮內膜組織出現在子宮腔覆蓋膜以外的身體其他部位時，稱爲子宮內膜異位症。異位部分子宮內膜受性激素的影響生長，發展或消失。月經前後或月經期間，小腹、腰痛和其他全身不適，影響工作和生活的，被稱爲痛經，也稱爲腹痛。痛經是子宮內膜異位症最突出的表現。
子宮內膜異位症的主要症狀是痛經、性交痛、不育、月經紊亂。異位子宮內膜隨內分泌週期變化，月經期間同樣出血，但不能像月經那樣流出體外，而是留在異位的部位。因此，痛經從月經前1~3天開始，持續到月經後幾天，逐漸惡化，甚至可以休克。也有肛門膨脹、噁心、嘔吐、腹瀉等症狀，痛苦。異位病竈反覆發作，月復一月形成腫塊，含舊褐色血液，俗稱巧克力囊腫。經血不斷積累，向外擴展，刺激鄰近組織增生，骨盆粘連，可產生性交疼痛，夫妻同室受到限制。異位症引起卵巢功能異常，月經紊亂，經期延長，無遺漏。卵巢內分泌失調，已婚婦女不育，據資料統計，不育患者約佔50%。
早期治療目前常用的藥物治療方法如下:
(1)妊娠激素治療暫時緩解症狀，防止病情繼續發展。常用藥物爲炔諾酮(婦康片)、甲基地孕酮(婦寧片)、安宮孕酮(甲基地孕酮)口服。
(2)假妊娠療法長期服用大量高效妊娠激素，輔助少量雌激素防止突破性出血，引起類似妊娠的人工閉經，稱爲假妊娠療法。臨牀上常用高效或長效的孕酮類藥物，如自己的酸孕酮、安宮孕酮、甲基孕酮、炔諾酮等，加入一定量的雌激素。該方法的應用可使異位內膜組織發生脫膜樣變、間質浮腫、內膜壞死、萎縮治療子宮內膜異位症，明顯緩解症狀，病竈縮小或消失，症狀緩解率達80%，好轉率達20%~40%，但停藥後複發率高，突破性出血
(3)假閉經療法達那唑爲17a-乙炔睾酮衍生物，具有輕度雄激素的作用，也具有蛋白合成功能，沒有雌激素和妊娠激素的作用，用藥後暫時減少卵巢激素的分泌，使子宮內膜萎縮，暫時閉經有調節下丘腦垂體卵巢軸的作用，通過下丘腦抑制排卵前高峯的出現，直接作用於子宮內膜雌激素的受體，抑制內膜的成長。用藥期間，排卵功能受到抑制，痛經症狀迅速消失，治療結束後30~45d恢復排卵功能，提高妊娠率，妊娠率達到50%。藥物的不良反應是體重增加、水腫、乳房縮小、更年期綜合徵，如頭痛、熱、性慾減退等。該藥由於肝臟代謝，用藥期間GPT明顯上升，患者經常中途停藥，但停藥後GPT正常。
(4)雄激素治療一般在少量甲基睾丸素舌下服用，連續服用3~6個月或大量丙酸睾丸酮治療，在25mg肌肉內注射，每週2次。以上兩種藥物每月總量不得超過300毫克。大量雄激素治療可以通過下丘腦垂體抑制排卵和閉經的小量應用可以間接地通過雌激素的作用或直接作用於子宮內膜，影響局部代謝，使異位內膜軟化和退化。個別患者用藥後可出現男性化徵象。雄激素的應用一般適用於接近更年期或更年期的患者。
(5)妊娠三烯酮(內美通)是去除19睾酮的衍生物，具有較強的妊娠激素和雌激素作用，抑制垂體FSH和LH分泌，抑制排卵，降低體內雌激素水平，異位內膜萎縮。用法:2.5mg每週2次，月經週期第1天開始，連續服藥3~6個月。不良反應一般較輕，可承受。其不良反應爲陰道滴出血、體重增加、潮熱等。
(6)促性腺激素激動劑(GnRH-a)是人工合成的9肽類化合物，其作用比天然GnRH強幾十倍。用藥後，與垂體特異性受體結合，抑制促性腺激素分泌，卵巢分泌性激素下降，暫時閉經，臨牀也稱爲藥物性卵巢切除。用藥後可使異位病竈萎縮和消失，改善症狀。臨牀上可應用的GnRH-a製劑有很多種，有鼻腔噴霧和皮下注射等。其不良反應是雌激素水平低引起的更年期綜合徵。
(7)三苯氧胺(TMX)是非固醇類雌激素類藥物，是二苯乙烯衍生物，其順式異體具有雌激素作用，逆式異體具有雌激素作用。通過與細胞漿中的ER競爭性結合，形成TMX-ER複合物，運輸到細胞核中長期積存，複合物最初具有雌激素樣本的作用，但後來無法更新產生細胞漿ER，最終表現爲雌激素的作用。可以明顯緩解症狀，改善體徵。其不良反應有輕度潮熱、出汗、月經不規律等，停藥後症狀逐漸消失。但是，由於其致癌作用的存在，現在幾乎沒有使用或應用少。
(8)米非司酮米非司酮作爲受體水平的抗孕酮藥物，代替體內孕酮，與孕酮受體結合抑制孕酮活性，卵巢孕體溶解，體內孕激素和雌激素水平下降。因此，長期連續用藥會導致閉經，子宮內膜和異位內膜會萎縮。該法的應用目前正處於臨牀試用、觀察階段。
(2)手術治療
手術治療分爲保守手術(保留生育功能的手術)、半保守手術(保留卵巢功能的手術)、根治手術3種。
保守手術(保留生育功能的手術)子宮內膜異位症發生在生育年齡的女性中，對於要求生育的年輕患者，在男性生育功能正常的情況下，特別是患者通過藥物治療無效者，可以選擇保守手術，在情況允許的情況下，儘量保留卵巢(或者部分卵巢)、輸卵管和子宮，儘量切除肉眼可見的盆腔病竈，分離粘連，恢復盆腔器官的正常解剖，同時處理盆腔創面，防止術後粘連
(2)半保守手術(保留卵巢功能的手術)年齡在45歲以下，無生育要求，或者患者年齡輕，但臨牀症狀嚴重，病變廣泛，無法保留生殖功能，或者藥物治療效果差的人，可以進行半保守手術，切除子宮，儘量切除骨盆內膜異位病竈
(3)根治性外科患者年齡在45歲以上，患者年齡輕，無需保留生殖功能者，病變廣泛，臨牀症狀嚴重，藥物治療無效，或者手術中異位病竈不能防止復發和手術後復發的患者，全宮和雙側卵巢雙側卵巢切除後，由於失去卵巢內分泌功能的支持，盆腔殘留的病竈可以逐漸萎縮治癒。
(3)藥物與手術的合作
1、手術前藥物治療
病變嚴重者，病竈可侵入骨盆腹膜、腸管、膀胱、輸尿管、子宮直腸凹陷、直腸陰道隔離等部位，與周圍組織廣泛粘連，手術時難易度高，同時切除病竈爲了解決上述術中的問題，主張在手術前應用激素治療。手術前應用妊娠激素治療，軟化爐竈，易分離粘連，可縮小爐竈和藥後脫膜反應，增加手術活動度，有利於粘連分解和爐竈切除，減少術中出血，降低手術難度。手術前可選用3~6個月的藥物。
2、手術後的藥物治療
保守手術和半保守手術後，爲了防止手術後復發，手術後3~6個月的藥物治療可以治療肉眼看不見或深處不能切除的病竈。手術後需要生育的患者，也有學者反對，認爲手術是治療子宮內膜異位症的最佳臨牀手段，術後短期粘連尚未形成，是妊娠的最佳時期，激素治療後恢復排卵至少需要半年時間，失去妊娠的最佳時期，不主張術後用藥。
