胃腸功能障礙可用顛茄片、多潘立酮、乳果糖、蒙脫石散、乳糖酶等藥物治療。
腸功能障礙通常被稱爲腸易激綜合徵。腸易激綜合徵包括腹瀉型、便祕型和腹瀉便祕交替型，可表現爲反覆腹痛、腹瀉、便祕或腹瀉便祕交替。診斷上採用排除診斷，指患者經多次檢查未確診爲器質性疾病，但患者表現出上述症狀，且症狀復發，故歸類爲腸易激綜合徵。胃腸功能紊亂以藥物治療爲主，但在選擇藥物時需要根據不同的症狀選擇不同的藥物。部分患者在發作期以劇烈的胃腸道疼痛爲主要症狀，需要使用解痙止痛藥物，如阿托品、顛茄片等，可解除平滑肌痙攣以緩解疼痛。消化不良的症狀可以通過使用促進胃腸蠕動的藥物來改善。比如多潘立酮可以協調胃腸運動，減少食物在胃裏停留的時間。有些便祕患者在發病時可以用瀉藥治療。例如，乳果糖不僅能保留結腸中的水分，還能調節腸胃的生物節律，因此能緩解習慣性便祕和頑固性便祕。腹瀉患者可使用蒙脫石散進行止瀉治療。蒙脫石散不僅止瀉效果好，而且不會進入血液循環，對人體副作用小。食物消化不良患者可以在平時適當補充乳糖酶，促進胃中食物的消化。
注意，大多數甜食都含有奶油和精製糖，尤其是高糖食物，如糯米巴贊、雪媚娘、甜月餅、奶油蛋糕等，以免吃多了引起脹氣，影響腸道的正常功能。患者平時一定要避免。吃不刺激的食物，如辣油、辣椒粉、花椒粉、五香粉、大蒜、麻辣燙、麻辣小龍蝦等食物，不僅刺激，而且燥熱。吃多了會傷津液消耗，引起大便乾燥和便祕，加重腸道功能紊亂。患者要儘量避免。
