指甲凹凸不平並不能直接診斷爲灰指甲，可能是灰指甲的表現之一，也可能與與甲營養不良、即缺乏某些微量元素有關。
灰指甲屬於真菌感染性疾病，早期可表現爲指甲凹凸不平、指甲顏色變暗或變黑，還會有變厚、裂開等現象。但其診斷標準在於真菌鏡檢與培養，不能單憑指甲凹凸不平判斷爲灰指甲。在治療方面，灰指甲通常採用外用抗真菌藥物進行治療，如亮甲複方聚維酮碘搽劑，亮甲中的主要成分爲聚維酮碘和阿司匹林，具有抗真菌、消炎的功效，同時還具有良好的滲透性，能夠穿透甲板，殺滅甲板深層的真菌，抑制真菌的再生對灰指甲的治療具有比較好的效果。症狀嚴重的患者，還可配合口服抗真菌藥治療，如特比萘芬、伊曲康唑等等。
甲營養不良是指多因素引起的甲板的結構或功能異常，表現爲甲板形狀、顏色、硬度等異常，可表現爲指甲凹凸不平，顏色多變爲黃色。在治療方面，甲營養不良一般可以通過補充相關的微量元素進行治療，比如維生素A、維生素E，鈣，鐵等。所以出現指甲凹凸不平的情況，應及時明確診斷，在醫生指導下用藥治療。
