慢性腸胃炎一般不能自愈。
慢性胃腸炎是指由病原微生物感染、腸道菌羣失調、服用某些藥物、十二指腸-胃反流刺激以及接觸大量放射性物質等原因引起的胃腸黏膜慢性炎症，患者主要表現爲腹痛、腹瀉、便祕、裏急後重等症狀。雖然不同病因引起的慢性胃腸炎的預後有所不同，但本病一般不能自行恢復。患者應積極在醫生的指導下，使用藥物進行治療。常用的藥物包括1、抗生素。對於病情嚴重、免疫力低下的患者可根據細菌藥物敏感試驗結果選用合適的抗生素進行治療，主要包括環丙沙星、慶大黴素、左氧氟沙星等。2、止瀉藥。腹瀉爲慢性腸胃炎的常見症狀，腹瀉嚴重者可使用蒙脫石散、洛哌丁胺等止瀉藥治療。3、微生態製劑。如雙歧桿菌、乳酸菌素片等，該類藥物可調節胃腸道菌羣，改善胃腸道環境，緩解腹瀉等症狀。4、解痙鎮痛藥。腹痛明顯的患者可適當使用山莨菪鹼、阿托品等藥物來緩解胃腸道痙攣，減輕疼痛。5、抑酸藥。其中包括質子泵抑制劑和H2受體拮抗劑兩類，可抑制胃酸分泌，減少胃酸對胃黏膜的刺激，常用的藥物有奧美拉唑、法莫替丁等。
患者要注意保暖，避免腹部受寒。要控制飲食，保持飲食的規律性，避免暴飲暴食，避免進食的不規律。應食用較爲清淡且容易消化的食物，不要吃腐敗變質的食物及大量的生冷瓜果或寒涼食品。可以適當按摩腹部，也可適當進行運動和鍛鍊增強體質，有助於調節胃腸道功能。
