如果男性在有風險的性接觸後出現紅斑、水泡、膿皰和陰莖上出現紅斑、水泡、膿皰和潰瘍，並伴有疼痛和灼燒感，應懷疑他們可能患有生殖器皰疹。如果水泡和潰瘍反覆出現在同一部位，可能是生殖器皰疹的復發。
生殖器皰疹的男性和女性在早期階段有不同的表現。如果女性有不潔的性交史，然後在大陰脣、小陰脣、陰道口和肛門周圍出現水泡、潰瘍和疼痛，並伴有白帶增多和膿性白帶，則應考慮患生殖器皰疹。女性無反映的病毒伏擊感染比男性更常見，是主要感染源。
生殖器皰疹的男性和女性在早期階段有不同的表現。男性生殖器感染病毒後，大約一半的人沒有任何不適，不知道自己生病了，但病毒已經伏擊並可能感染；給別人。
由於單純皰疹病毒在人體內沒有持久的免疫力，當生殖器皰疹患者的抗病能力下降時，如發熱性感染、胃腸功能障礙、月經、妊娠、病變感染、過度疲勞、情緒環境變化等。單純皰疹病毒-1主要導致脣皰疹、咽炎、角膜結膜炎和散發性腦炎，而單純皰疹病毒-2主要導致生殖器皰疹，但臨牀情況相反。
單純皰疹病毒感染的埋伏期爲1-45天，平均爲6天。單純皰疹病毒-1感染主要發生在皮膚粘膜的交界處，如口角、脣緣、鼻孔等。也可以看到面部或嘴脣。一開始有灼癢感和輕微緊張感，偶爾伴有神經痛，然後出現紅斑，在紅斑的基礎上出現簇狀丘疹，迅速變成小米到綠豆大小的水泡。
