多數性傳播疾病的症狀表現在生殖器上，如梅毒、淋病、尖銳溼疣等，病症表現在生殖器上。但也有些性傳染病，還可以發生在生殖器以外的某些器官上甚至全身，如艾滋病等，極易造成誤診、誤治。
淋菌性口腔、咽喉疾病
主要由口交引起。淋菌性口腔疾病的常見症狀是口腔硬齶上出現贅肉，表面不平整，呈菜花狀突出的喉嚨疾病的常見症狀是喉嚨紅腫，扁桃體增大，按上感治療幾乎沒有效果。
淋菌性眼病
性傳播疾病之一種，有成人型、兒童型及嬰兒型三種。成人型多爲患者自己用手揉眼睛時感染，兒童型多爲父母或保姆感染，嬰兒型多爲出生時出生的。莆田墟狀主要表現爲眼瞼紅腫、結膜充血、眼球表面形成片狀假膜。一開始可以看到紅色的水樣或血樣分泌物，紅腫減輕後，眼瞼裂開會流出膿性分泌物，分泌物中有大量的淋球菌。
直腸綜合徵
性傳播疾病之一種，是一組以排便痛、癢、大便呈黏液爲主要症狀的疾病，多發於同性戀有直腸性交史者，少數患者是生殖道感染淋菌後傳播到直腸部位，病原體多爲淋病雙球菌、梅毒螺旋體、沙眼衣原體、單純皰疹病毒等。
淋浴性關節炎
淋浴性關節炎患者中的40%-60%是淋浴雙球菌感染引起的。此病具有受累關節不對稱、多關節發病、發病前皮膚上有紅斑膿皰或手腳腱鞘炎等特點。80%的患者可從其宮頸、直腸、尿道或咽部培養出淋球菌。
性傳播疾病性肝周炎
這種疾病是性傳播疾病的原體通過血液傳播到肝臟，一部分患者表現爲心肌心包炎、肺炎等。
常見症狀有右上腹劇烈疼痛、壓痛和反跳疼痛，伴有發燒、下腹疼痛等盆腔炎症狀，但無肝腫大、黃疸的急腹症。其病原體爲淋病雙球菌、沙眼衣原體或支原體等。
