新生兒便祕是一種常見病症，其原因很多，概括起來可以分爲兩大類，一類屬功能性便祕，這一類便祕經過調理可以痊癒；另一類爲先天性腸道畸形導致的便祕，這種便祕通過一般的調理是不能痊癒的，必須經外科手術矯治。大多數嬰兒便祕是功能性的。寶寶飲食過少，消化後殘渣少，自然大便少。牛奶中糖量不足，大便乾燥。長期飲食不足，營養不良，腹肌和腸肌力不足，大便無法解除，頑固性便祕。
大便的性質與食物成分有關，食物含有多種蛋白質，碳水化合物(糖和澱粉)不足，大便乾燥，排便次數少的食物含有多種碳水化合物，排便次數增加，大便變軟的食物含有脂肪和碳水化合物一些細膩的食物缺乏渣滓，進食後容易引起便祕。有些小兒生活沒有規律，沒有按時解大便的習慣，使排便的條件反射難以養成，導致腸管肌肉鬆馳無力而引起便祕。另外，如營養不良、佝僂病等疾病，腸道功能失調，腹肌弱或麻痹，也會出現便祕症狀。
