因爲骨囊腫會出現骨質部分的很多地方，在平時對於骨囊腫治療還需要採取手術方式，這對患者的創傷性非常大，因此可以採取一些預防的措施來防止骨囊腫發生。
1、要早期預防，由於在頜骨上也會出現骨囊腫的現象。因爲恆牙形成以及生長和發育都是在胚胎期與兒童期完成，所以在兒童期就需要做好牙病的預防工作。兒童要少吃甜食，並且每日刷牙兩到三次。如果發現牙齒有疾病的話就需要及時治療。
2、早期檢查，在孩子的換牙期間家長一定要仔細觀察孩子的口腔中是否存在畸形的牙齒，而且到換牙期時，牙齒是否按時出現。在相近的出牙地方，牙齒是否有移位，傾斜現象。如果發現了異常，要及時的帶孩子去醫院檢查。
3、早期治療，發現了牙源性的和骨囊腫，就需要進行手術治療。通常在膿腫比較小的時候，骨質破壞情況也比較小，就可以完整地摘除，這樣可以減輕創傷面，而且還能減輕面部的畸形，也比較有利於咀嚼功能的恢復。在進行手術時是需要選擇抗生素，以免發生感染。
骨囊腫雖然不是惡性腫瘤，但是如果嚴重的話，也會危及到患者的生命。因爲囊腫比較大，就會影響到正常的生活，而較大囊腫也會破壞骨質，這樣就容易形成骨折現象。
