潰瘍性結腸炎屬於自身免疫性疾病，不能根治，但可以臨牀治癒，也就是說可以達到臨牀症狀完全緩解。潰瘍性結腸炎輕度及長期緩解者預後較好，但如果沒有很好的治療，病情嚴重的話，是會出現併發症的，這樣會威脅到身體健康，因此一定要積極的去治療才行。
如果服藥治療了3-5年，假如沒有再次出現，是能夠停藥的，但是需要諮詢一下醫生，不要擅自停藥。潰瘍性結腸炎如果治療不好，是容易發生併發症的，比如中毒性巨結腸和腸癌都是非常容易的併發症，這兩種疾病出現以後預後就特別差了。
潰瘍性結腸炎的預後和病情、併發症、治療的條件等都有關係。雖然潰瘍性結腸炎病程很長，多次緩解之後又反覆，並不容易治療好，但配合治療多數人預後是很好的。爲了防止病情變得嚴重，一定要及早的去藥物治療，如果結腸炎比較嚴重，還需要手術來治療的，這樣纔可以讓身體早日好轉，以免併發症出現，一定要聽從醫生的意見，觀察病情的發展，以免病情嚴重危害健康。
