睾丸萎縮是由於某種原因睾丸逐漸萎縮變小的情況，一般是由以下原因造成：
1、藥物影響。長期服用某些有毒性藥物，例如砷劑，或者反覆使用對抗雄激素的雌激素類藥物，例如乙芪酚等，都會引起萎縮。
2、病毒感染是誘發兒童與青少年睾丸的萎縮最爲常見的病因。尤其是流行性腮腺炎病毒，俗稱爲痄腮病。當睾丸受此病毒侵襲後，睾丸內的生精組織會受到破壞，睾丸體積縮小，質地變軟。
3、炎症重度睾丸炎。發病時睾丸腫脹、疼痛，可以持續多日。由於細菌侵犯而造成睾丸組織破壞，導致睾丸組織發生萎縮。
4、放射性物質影響。凡是較長時間接觸放射性物質者，例如長期從事X線、同位素等職業人員，如未作很好保護，會引起萎縮症。
5、損傷或撞擊造成。損傷陰囊或睾丸部位發生過撞擊性損傷，造成陰囊血腫或睾丸裂傷等，即使創傷癒合，睾丸也會長期處於供血不充裕狀態，發生萎縮。
