一些乙肝患者在服用核苷(酸)類藥物治療後一般都要定期複查乙肝五項、HBV DNA和肝功能。現在大多數醫院都能進行乙肝表面抗原的定量檢測，一些患者看到自己檢測結果中乙肝表面抗原(HBsAg)經常有波動，就特別擔心病毒耐藥，甚至有一些醫生也把這一指標誤認爲是病毒耐藥的指標，來回給病人改變治療方案。
乙型肝炎病毒複製離不開一種酶的作用，這種酶被稱爲：DNA聚合酶(HBV DNA-p)。DNA聚合酶存在於乙型肝炎病毒的內核，與乙型肝炎病毒核心抗原(HBcAg)、e抗原(HBeAg)和病毒基因(HBV DNA)共同構成乙型肝炎病毒的核心。在DNA聚合的作用下，乙型肝炎病毒基因才能按照一定的“模板”複製出螺旋狀的病毒DNA鏈。
沒有DNA聚合的作用，乙型肝炎病毒的複製就會停止。核苷(酸)類藥物的作用機制中假扮成HBV DNA複製時所需要的核苷酸，與DNA聚合酶競爭性結合，代替了乙肝病毒複製時需要的真核苷酸，阻止的乙肝病毒基因鏈的延長，導致乙肝病毒複製中止。藥物作用的部位也就是發生耐藥的位點，這一部位常常受到藥物的攻擊，被“打皮”了，產生了“耐受性”這發生了耐藥。
耐藥後，乙肝病毒複製失去了抑制，HBV DNA水平就會升高。所以，病毒耐藥的部位發生在DNA聚合酶的部位，耐藥的表現是HBV DNA升高。而乙肝表面抗原不是藥物攻擊的部位，所以，它的升高與降低與乙肝病毒對核苷(酸)類藥物的耐藥無關。
乙肝病毒表面抗原的高低在乙肝病毒cccDNA有一定的相關性，雖然它的高低與病毒耐藥無關。但乙肝表面抗原的波動卻能夠表明不能隨便停藥，乙肝病毒複製的模板cccDNA在體內還有很多，停藥後很可能反彈。
