營養代謝缺乏疾病病變的相關證據如有煙酸維生素B1和葉酸缺乏的營養不良史，營養代謝缺乏導致相應功能異常的症狀和體徵，這些可以作爲營養代謝疾病伴發的精神障礙的診斷條件。
營養代謝缺乏可以通過以下檢查項目確診：
1、新生兒疾病篩查
新生兒疾病篩查是一種簡易、快速和廉價的血斑試驗，通過篩查可以及早發現孩子是否患有先天性遺傳病，並進行及時治療，使其健康成長。有些先天代謝性疾病，雖發病率很低，但能嚴重影響智力發育，且可導致終身殘疾，在出生前無法作出診斷，出生後早期又沒任何症狀，但是，一旦出現異常情況，則神經系統已受到不可逆轉的損害，失去了治療機會。若能在出生後早檢查，早發現，早治療，則可使患兒免受損害，避免出現智力低下。
2、顱腦CT檢查
顱腦的CT檢查是通過CT對顱腦進行檢查的一種方法。頭顱CT是一種檢查方便，迅速安全，無痛苦，無創傷的新的檢查方法，它能清楚的顯示顱腦不同橫斷面的解剖關係和具體的腦組織結構。因而大大提高了病變的檢出率和診斷的準確性。總體上講，CT對人體硬組織的顯像要比軟組織的更好。頭顱CT檢查對於顱內、顱骨、頭皮的大部分疾病的診斷有重要意義(包括外傷、腫瘤、炎症、血管病變、中毒、變性和代謝性疾病等)。
3、EEG
腦電圖檢查是通過儀器，從頭皮上將腦部的自發性生物電位加以放大記錄而獲得的圖形。腦電圖檢查對腦部疾病有診斷意義。異常腦電圖可分爲輕度、中度及重度異常。
4、腦多普勒超聲(TCD)
通過腦多普勒超聲對腦進行檢查的一種方法。經顱彩色多普勒顯象：經顳窗、枕窗、眶窗探查，可探及大腦動脈，根據顱內血管的流速、頻寬、流向異常或音頻異常等確定，應用於腦血管疾病的診斷及病因分類。
5、身體器官功能與營養
身體器官功能與營養是與食物的攝入、消化、吸收和代謝等因素密切相關，好壞可作爲鑑定和疾病程度的標準之一，也是診斷身體器官功能的標準之一。
