宮內感染是乙肝媽媽體內內的病毒透過胎盤傳播給胎兒，使寶寶在媽媽子宮內就感染了乙肝病毒。產時感染是指圍分娩期新生兒在分娩時吞嚥了含有HBV的母血、羊水、陰道分泌物，或在分娩的過程中，因子宮收縮使胎盤絨毛血管破裂，致使少量母血滲漏入胎兒血循環引起嬰兒感染HBV 。產後感染實際上屬於HBV感染母親和孩子的水平傳播，主要是通過生活中密切接觸傳播。
大量的流行病學資料證明，在沒有使用乙型肝炎疫苗和乙肝免疫球蛋白(HBIG)主動+被動聯合免疫進行母嬰阻斷的情況下，產時感染佔絕大多數，約爲80%～85%;產後感染約10%～15%，產前宮內感染就母嬰傳播中最少見的傳播方式，大約5%～10%。
目前的研究發現，宮內感染與母親體內的HBV DNA水平有關。母親血清HBV DNA>106拷貝/ml者，容易發生宮內感染。宮內感染多發生在妊娠第三期(孕28周)以後。高病毒複製的乙肝媽媽在妊娠第三期服用拉米夫定、替比夫定或替諾福韋抗病毒治療，降低體內乙肝病毒的複製水平可以明顯減少宮內感染的機率。
對HBV宮內感染診斷指標尚未統一，因此無法準確判斷新生兒感染的時間。目前普遍接受2001年第二屆“阻斷HBV母嬰傳播和乙型肝炎免疫與臨牀應用學術會議紀要”提出的HBV宮內感染定義：HBsAg(+)母親的新生兒出生時從其外周靜脈採血測到乙肝病毒複製標誌物的存在，採用主動+被動聯合免疫進行母嬰阻斷後無免疫效果者，乙肝病毒複製標誌物持續陽性至少3 個月以上。
另外，也有人採用《乙型肝炎基礎和臨牀》(第二版)中提出的診斷標準：HBsAg(+)母親的新生兒出生時從其外周靜脈採血測到乙肝病毒複製標誌物或HBsAg;且在以後複查中，1月齡檢測HBsAg 陽性爲宮內感染的初篩診斷標準，6月齡檢測HBsAg仍爲陽性爲確診標準。
