新冠疫苗是指新型冠狀病毒疫苗。扁平疣可以採用局部外用藥物治療及物理治療，常用藥物包括水楊酸、干擾素凝膠、免疫製劑等，因其所服用的藥物中，有符合新型冠狀病毒疫苗打禁忌證，建議在疾病急性發作期、服藥期間禁止打新型冠狀病毒疫苗，病情穩定的情況下可正常打。
新型冠狀病毒疫苗屬於最新研發的滅活性疫苗，因臨牀應用時間較短，還存在着許多未知的風險。如果患有某些疾病，不允許打新型冠狀病毒疫苗。而扁平疣是因HPV感染所引起的病毒性皮膚疾病，其主要傳播方式爲直接接觸或間接接觸。
新型冠狀病毒疫苗的禁忌證中，沒有明確指出患有扁平疣的患者不能打新型冠狀病毒疫苗，但因扁平疣治療需採用藥物治療，所以在疾病急性發作期或服藥期間，儘量避免打新型冠狀病毒疫苗，防止新型冠狀病毒疫苗與藥物產生相互作用，影響新型冠狀病毒疫苗的效果及加重身體不適症狀，穩定期可正常打。
