隨着新的、有效的非侵入性治療方法的出現，如西地那非和尿路外用比法爾(PGEl)等的使用，使得病史和體格檢查在勃起功能障礙的診斷中顯得尤爲重要，因爲許多病人希望直接開始治療而不願先做那些侵入性檢查。但是，少數勃起功能障礙患者(約佔15%)由於對非創傷性治療無效，爲進一步瞭解勃起功能障礙確切發病原因和機理，就需要針對治療方法，有選擇地作以下項目中某些檢查。
(一) 夜間陰莖勃起監測
健康男性自嬰孩時間至年邁老人，夜間做夢時常伴快速眼球運動而出現夜間陰莖勃起，每晚平均有三次以上，其總共時間約100min，其生理意義除可把較多氧氣帶入陰莖外，臨牀上還可幫助區分心理性勃起功能障礙還是器質性勃起功能障礙。凡是由心理性原因引起的勃起功能障礙患者，仍會有正常的夜間勃起(NPI)，相反，因血管性、神經性和內分泌性勃起功能障礙患者夜間勃起次數減少，硬度也明顯減弱。但仍要綜合分析，夜間陰莖勃起監測具體方法有：
1.郵票試驗：於睡前將郵票環繞陰莖中部一圈粘貼，鬆緊以緊靠疲軟狀態下陰莖皮膚爲度。第二天清晨觀察郵票齒緣有否斷裂來判斷陰莖有無勃起。操作簡便，可粗略判斷勃起情況。
2.紙帶試驗(Snap-Gauge試驗)：將含有三種不同拉力條帶的測試環於夜間臨睡前固定於陰莖上，第二天清晨觀察拉力帶有否斷裂及斷裂條數，以此來判斷夜間有無陰莖勃起及勃起的強度。該方法較爲實用，成本低廉，可操作性強，但精確度略差。
3.夜間陰莖勃起測定系統—NEVA：系美國AMS最近推出的一種連續測定陰莖勃起次數、持續時間、長度、粗細與血容量變化之生物電測定系統。體積小而輕，較全面的瞭解陰莖夜間勃起情況。
(二)陰莖肱動脈指數(PBI)
採用袖珍多普勒超聲監聽儀的探頭置於陰莖背側皮膚表面，調整位置和角度，聽到撲動聲音後，將圍繞陰莖根部小型血壓測量充氣袖帶，按測肱動脈血壓方法分別測出兩側陰莖海綿體內動脈血壓。PBI=陰莖動脈血壓÷肱動脈血壓，如PBI>0.75，表明陰莖動脈血流正常，若PBI<0.6，提示陰莖動脈血流異常。
(三)陰莖海綿體注射血管活性藥物試驗
常用的藥物有：罌粟鹼、酚妥拉明、前列腺素E1及血管活性腸肽等，雖然作用機制不同，但最終均導致陰莖海綿體動脈爲海綿竇平滑肌鬆弛，血流阻力減低，使海綿體動脈灌注增加，海面竇膨大，壓迫迴流靜脈，使海綿體靜脈迴流降低，導致勃起。
常用藥物劑量因人而異，隨不同病因可行調整。單劑量使用罌粟鹼在10～30mg，前列腺素E1爲5～40mg。三聯混合製劑罌粟鹼30mg/ml，酚妥拉明0.5 mg/ml及前列腺素E1 10 mg/ml，混合製劑的用量爲0.1 ml～2ml，從小劑量開始，逐漸加大調節至最佳劑量，常用劑量在0.25 ml ～1 ml。
選擇一個安靜舒適環境，配合性刺激效果更好。翻起包皮，用拇指及食指牽住陰莖貼在一側大腿上，選擇一側陰莖海綿體近恥骨處陰莖海綿體側方中段作爲注射部位。消毒後避開淺表血管，以皮試針將藥物注入海綿體，如遇阻力或注射部位疼痛，應停止注射，去針後局部壓迫3～5min後進行觀察。分別測量勃起前後的陰莖長度、周徑以及站立位陰莖與大腿的夾角(勃起角)。勃起角>90°，收縮盆底肌肉有陰莖運動者，證明硬度好，無血管病變;60°以下提示血管性勃起功能障礙，60°～90°爲可疑血管病變，需作其它檢查。
