由於抗生素全身藥物在前列腺中難以達到有效濃度，影響療效，因此出現了直接將抗生素注入前列腺的治療方法。其具體方法是選擇對症抗生素，單獨或共同應用，在會陰部直接注入的列腺部分，或者在超聲波引導下直接注入前列腺，每週1~2次，10次爲療程。
這種治療方法的主要優點是藥物直接注入前列腺，容易擴散，達到有效的抗菌濃度，不僅可以殺死注射部位的細菌，還可以殺死周圍組織的細菌，藥物部分吸收血液，尿道和其他部位的感染
但也有難以克服的缺點。主要是
(1)前列腺部位深，直接注射不容易，穿刺會損傷周圍組織，引起血尿。
(2)穿刺會引起疼痛不適，反覆進行的話，患者很難接受。
(3)經皮膚或直腸穿刺，細菌可帶人，引起前列腺重複感染。
(4)多次穿刺可引起前列腺纖維組織增生、前列腺硬化，肛門診斷時前列腺內接觸硬結，接觸硬質前列腺。纖維組織增生會使病竈分離包圍，抗生素難以滲透，前列腺液排出困難。因此，在選擇這種治療方法時必須小心。只有當其他方法無效時，才能考慮這種方法。穿刺不應該太頻繁。每週穿刺1-2次。療程不應該太長，應該控制在1-2月左右。
