常見的病原體包括細菌、真菌、支原體、衣原體、放線菌、寄生蟲以及病毒等，其中以細菌感染最爲常見，細菌感染是細菌性前列腺炎的病因。細菌可以單獨感染，也可以與兩種以上的細菌混合感染。
一種或多種細菌與真菌、支原體或衣原體混合感染比較常見。人體乳頭瘤病毒、單純皰疹病毒ⅱ型和人類鉅細胞病毒與慢性前列腺炎密切相關。陰道毛滴蟲是引起前列腺炎的常見病原體之一。
包蟲、絲蟲或阿米巴原蟲感染引起的前列腺炎也有報道。放線菌可引起前列腺慢性感染，主要是由內源感染引起的。克雷白菌和假單胞菌屬等也成爲慢性細菌性前列腺炎的病原菌。
革蘭陽性細菌是前列腺液細菌培養中常發現的微生物，作爲明顯的病原菌的病例，特別是對只培養革蘭陽性細菌(不包括腸球菌)的患者進一步研究，可以反覆發作慢性細菌性前列腺炎，這些病原菌可以引起泌尿系統感染
但革蘭陽性細菌能否引起前列腺炎仍存在爭議，很多學者認爲類腸球菌能引起慢性前列腺炎，與複發性腸球菌尿有關，但其他革蘭陽性細菌在前列腺炎中的病因作用，如凝固酶陰性葡萄球菌、鏈球菌、細球菌、類白喉桿菌還不確定。
這種革蘭陽性細菌普遍存在於正常皮膚粘膜中，主要存在於正常男性的前尿道中，一般認爲是共生細菌，而不是病原菌。
