慢性腸炎病程一般在2個月以上，臨牀上常見的有慢性細菌性痢疾、慢性阿米巴痢疾、血吸蟲病、非特異性潰瘍性腸炎和限定性腸炎等。腸炎極爲普 遍，全世界每年發病約30～50億人次，尤以發展中國家發病率和病死率爲高，特別是兒童。據世界衛生組織統計，在發展中國家中，傳染性腹瀉是兒童發病率最高的傳染病，病死率約爲20‰，僅在亞、非、拉地區，每年將奪走約460萬嬰幼兒的生命。
慢性腸炎是細菌和病毒引起者最常見的。少數腸炎的原因不明。細菌性腸炎的病菌最常見於痢疾桿菌，其次是空腸彎曲菌和沙門氏菌。在病毒性腸胃炎中，輪狀病毒是嬰幼兒腹瀉的主要原因，而諾瓦克病毒是成人和老年兒童流行性腸胃炎的主要原因。寄生蟲引起的腸炎在溶解組織內很常見。黴菌性腸炎是由白色念珠菌引起的最多的。另外，休息不規則和精神過度緊張也是引起這種疾病的原因之一。
