直腸癌的診斷多可以通過病史、體格檢查、便潛血檢查等判斷，確診多依靠內鏡檢查。直腸癌內鏡檢查主要包括直腸鏡、乙狀結腸鏡和纖維結腸鏡檢查，門診常規檢查時可用直腸鏡或乙狀結腸鏡檢查，操作方便，不需要腸道準備，但是明確直腸癌診斷需手術治療時應行纖維結腸鏡檢查，因爲有5%～10%的直腸癌爲多發癌。內鏡檢查不僅可在直視下肉眼做出判斷，而且可以取活組織進行病理檢查。
所有疑似直腸癌的患者均推薦內鏡檢查，但以下情況除外：一般狀況不佳，難以耐受；
急性腹膜炎、腸穿孔、腹腔內廣泛粘連以及完全性腸梗阻；肛周或嚴重腸道感染、放射性腸炎；婦女妊娠期和月經期。
纖維結腸鏡檢查之前，必須做好腸道準備，檢查前2～3日進流質飲食，服用瀉劑，或行清潔洗腸，使腸道內糞便排淨。內鏡檢查報告必須包括進境深度、腫物大小、距肛緣位置、形態、局部浸潤的範圍等檢查項目。
