類百日咳和百日咳區別之一就是引發疾病的病原體不同，症狀嚴重程度及治療方法也不一樣。
1、病原體不同
百日咳是由百日咳桿菌引起，類百日咳是由包括病毒在內的其他微生物引起。最常見是腺病毒，另外還有肺炎支原體、呼吸道合胞病毒及鉅細胞病毒等。
2、症狀嚴重程度不同
類百日咳和百日咳症狀幾乎一樣，但是這兩者症狀嚴重程度有一些差別。兩者都會引起痙攣性咳嗽，但是類百日咳症狀相對較輕，百日咳則較嚴重。
3、治療方法不同
類百日咳在痙咳期出現前可應用青黴素類藥物進行治療，能有效縮短病程。百日咳在卡他期及時應用抗生素治療可減輕症狀，甚至不會發生痙咳，進入痙咳期後用抗生素難以縮短病程。
