甲型H1N1流感的潛伏期，較流感、禽流感潛伏期長，潛伏期時長1～7天，多爲1-3天。部分患者病情可迅速發展，來勢兇猛、突然高熱、體溫超過38℃，甚至繼發嚴重肺炎、急性呼吸窘迫綜合症、肺出血、胸腔積液、全身血細胞減少、腎功能衰竭、敗血症、休克及Reye綜合症、呼吸衰竭及多器官損傷，導致死亡。患者原有的基礎疾病亦可加重。
通常表現爲流感樣症狀，包括髮熱、咽痛、流涕、鼻塞、咳嗽、咳痰、頭痛、全身痠痛、乏力。部分病例出現嘔吐、腹瀉。少數病例僅有輕微的上呼吸道症狀，無發熱。體徵主要包括咽部充血和扁桃體腫大。
需特別留意的7種重症甲流症狀
如果出現流感樣症狀後，發生以下情況之一的爲重症病例，需住院治療。包括：
1、持續高熱3天以上;
2、劇烈咳嗽，咳膿痰、血痰或胸痛;
3、呼吸頻率快，呼吸困難，口脣青紫;
4、反應遲鈍、嗜睡、躁動、驚厥等;
5、嚴重嘔吐、腹瀉，出現脫水錶現;
6、醫學檢查有肺炎徵象;
7、原有基礎疾病明顯加重。
