先天性代謝缺陷病的三大類型：
一種是通過該代謝途徑的某些終末產物缺乏，如過氧化酶體病、溶酶體病等，產生的症狀多爲持續性、進行性的，且與進食等因素無關；
一種是受累代謝途徑的中間和旁路代謝產物大量蓄積，如苯丙酮尿症、甲基丙二酸尿症、同型胱氨酸尿症、楓糖尿症、半乳糖血症等，通常都呈現累積物導致的中毒症狀，常見者如嘔吐、嗜睡、昏迷、生長髮育遲滯、低血糖、高氨血癥和酮、酸中毒等，其發病或早或遲，發病前常有無症狀期，或症狀呈間隙發作；
另一種是由於代謝途徑受阻而導致對肝、腦、肌等組織的供能不足，如糖代謝障礙。先天性高乳酸血癥、脂肪酸氧化缺陷、線粒體呼吸鏈功能障礙等，臨牀常見低血糖、高乳酸血癥、肌張力低下、體重不增等表現。
