由於避孕藥當中含有激素，激素會影響母乳質量，也會隨着母乳進入到嬰兒體內。所以哺乳期最好不要使用避孕藥作爲避孕方式。
哺乳期女性不宜選擇含有雌激素的口服避孕藥物。因爲雌激素有可能會導致哺乳期女性食慾不良，從而導致母乳中的蛋白質、脂肪以及微量元素下降，這樣並不利於寶寶的正常生長髮育。同時，含有雌激素的乳汁被寶寶攝入，可使男嬰乳房發育，女嬰出現陰道上皮增生、陰脣肥厚等副性徵的異常。此外，哺乳期婦女如果服用3~6個星期的雌激素，其乳量大約會減少一半，對母乳餵養的寶寶極爲不利。
而科學研究也經已證實，劑量比較高的雌激素會抑制母乳的分泌，而緊急避孕藥是一種單純的孕激素，並非雌激素，所以從成分上看是沒問題的。再看緊急避孕藥的代謝機制，一般服藥後24-48小時即能排除體外，並不會滯留在女性體內，可見也是沒問題的。只要在服藥後2天內停止母乳餵哺即可。
但是如果一旦發生沒有避孕的性行爲，緊急避孕藥還是要派上用場的。值得注意的是，嬰兒身體機能特殊，在哺乳期的女性服藥仍要謹慎，若發生性生活時也應多采取常規避孕措施，但當意外情況出現需要緊急補救時也應果斷服用緊急避孕藥進行避孕。
