一般情況下，睡覺醒來腎疼，可能是急性腎盂腎炎、腎結石、腎臟腫瘤等原因，可以通過抗生素治療、體外衝擊波進行手術、手術治療等方式處理。具體分析如下：
1.急性腎盂腎炎：急性腎盂腎炎的發生通常與感染有關，多半是細菌感染，會產生急性炎症，導致腎區疼痛。可伴隨尿路刺激症狀，如尿頻、尿急、尿痛等。需遵醫囑應用抗生素類藥物治療，如氧氟沙星片、阿莫西林膠囊、環丙沙星片等。
2.腎結石：腎結石是發生在腎臟部位的結石性疾病，隨着結石體積的不斷增大，會刺激腎臟黏膜，導致腎疼現象。睡覺醒來後突然活動，結石的位置發生改變，疼痛症狀比較明顯。可以多喝些溫開水，增加排尿量，並且多注意運動，觀察結石是否能夠排出。如果疼痛持續存在，則要及時就醫，在醫生的指導下通過體外衝擊波碎石的方式治療。
3.腎臟腫瘤：腎臟是腫瘤的高發器官，一旦患上腎臟腫瘤，可能會出現腎疼的現象，如腎臟透明細胞癌。腫瘤生長到一定大小後，會牽扯到腎被膜，從而引起腎疼。需要在醫生的指導下采取手術治療，儘量擴大手術範圍，術後還需做放療或化療。
除以上相對常見原因外，還有其他的可能性疾病，比如腎周圍炎。
