雖然山藥是一種藥膳類的食材，具有豐富的營養價值嗎，但是山藥是偏補的藥，甘平且偏熱，體質偏熱、容易上火的人要慎食。有些人愛用山藥涮火鍋，若再配上麻辣小料，那更是熱上加熱，也最好少吃。糖尿病者不可一次吃過量的山藥，食用量較大時應適當減少主食的量。雖然山藥能滋陰、補腎、降血糖，能治療糖尿病，六味地黃湯裏面也有山藥，但這裏有一個量的問題。如六味地黃湯中山藥量是有限的，也就是幾錢而已，而糖尿病患者如果要把山藥當食品吃，就會對血糖產生一定影響。山藥屬根莖類食物，澱粉量較高，過食可致血糖升高。
此外，消化性潰瘍和肝硬化患者，應選用蒸、燉等烹飪方法，忌爆炒和醋熘。胃腸道不好的人吃山藥時，不要同時服用小蘇打片等鹼性藥物，以免小蘇打使山藥中的澱粉酶失效。山藥中的薯蕷皁苷可以合成荷爾蒙，如睾丸激素和雌激素，因此，男性前列腺癌患者、女性乳腺癌患者都不宜食用。
山藥雖然可以與多種食材搭配使用，但是在進行搭配的同時還應該注意與其相剋的食物：
（1）山藥忌與鯉魚、甘遂同食
（2）山藥與甘遂不要一同食用；也不可與鹼性藥物同服。
（3）山藥與豬肝不能同食。山藥富維生素C，豬肝中含銅、鐵、鋅等金屬微量元素，維生素C遇金屬離子，則加速氧化而破壞，降低了營養價值，故食豬肝後，不宜食山藥。
（4）山藥與黃瓜、南瓜、胡蘿蔔、筍瓜。黃瓜、南瓜、胡蘿蔔、筍瓜中皆含維生素C分解酶，若山藥同食，維生素C則被分解破壞。
（5）山藥與海味不能同食。一般海味除含鈣、鐵、磷、碘等礦物質外，都含有豐富的蛋白質，而山楂、石榴等水果，都含有鞣酸，若混合食用會化合成鞣酸蛋白，這種物質有收斂作用，會形成便祕，增加腸內毒物的吸收，引起腹痛、噁心、嘔吐等症狀。
