男性不育的主要原因是生精障礙、輸精障礙、免疫因素等。
1、精液異常如無精子或精子數過少，活力減弱，形態異常。影響精子的原因是①先天性發育異常:先天性睾丸發育不完全不能生育精子，雙側睾丸引起曲細管萎縮等妨礙精子的發生。②全身原因:慢性消耗性疾病，如長期營養不良、慢性中毒(吸菸、酗酒等)、精神過度緊張，可能影響精子的發生。③局部因素:腮腺炎合併睾丸炎導致睾丸萎縮，睾丸結核破壞睾丸組織，精索靜脈曲張影響精子質量等。
2、精子運輸受精巢和輸精管炎症、結核堵塞輸精管，阻礙精子通過。例如陽痿、早泄、射精功能紊亂、逆行射精、尿道下裂等不能使精子進入女性陰道。
3、免疫因素精子對自己有抗原性，但免疫屏障不會對自己產生免疫反應:男性生殖道免疫屏障被破壞時，精子、精漿在體內對抗自己精子的抗體會產生男性不育，注射的精子自己凝聚，不能通過宮頸粘液。
4、內分泌功能障礙男性內分泌受下丘腦垂體睾丸軸功能障礙。例如性腺功能低、性腺功能亢進、雄激素不敏感綜合徵、高泌乳素血癥、甲減、甲亢等都會影響精子的產生而導致不孕。
5、性功能異常不能使精子進入女性陰道，如外生殖器發育不良、陽痿等性交困難。
