從控制感染源、切斷感染途徑、提高人體抵抗力三個方面着手:
1、初期:發現患者和有菌者，及時隔離和徹底治療是控制菌病的重要措施。從事餐飲業、保育和水廠工作的人需要長期追蹤，必須暫時離開工作崗位。
2、切斷：傳播途徑搞好“三管一滅”即管好水、糞和飲食以及消滅蒼蠅），養成飯前便後洗後的習慣。對餐飲行業、兒童機構工作人員定期檢查帶菌狀態。發現有菌的人，應立即治療和離開工作。
3、保護：易感人羣可口服依蓮菌株活菌苗，該菌無致病力，但有保護效果，保護率達85%～100%。國內已生產多價痢疾活菌苗。
