脂肪肝的病因學包括脂肪肝的發生條件(誘因)和脂肪肝的發生原因(原因)。在脂肪肝的發生發展過程中，機體的免疫狀態、營養因素、遺傳因素、生活方式、年齡和性別等發揮着相當重要的作用，即脂肪肝發病的條件因素。輕度或中度脂肪肝在消除病因和控制原發病後，肝組織學改變可以改善，甚至完全恢復正常，大多數藥物性脂肪肝在立即停藥後2~3個月內完全恢復正常。
脂肪肝的致病因素有化學因素、營養因素、內分泌代謝因素、生物性致病因素、遺傳因素等。
1。化學致病因素包括化學毒素(黃磷、砷、鉛、苯、四氯化碳、氯仿等)、藥物(甲氨蝶呤、四環素、胺碘酮、糖皮質激素等)、酒精等，嗜酒是歐美脂肪肝和肝硬化最常見的原因
2。營養因素飲食過多、體重過重引起的肥胖是近年來脂肪肝最常見的因素之一，蛋白質和卡路里不足是脂肪肝的另一個重要原因。
營養不良是慢性營養不足的疾病，主要是由於人體長期缺乏能量和蛋白質，因此可分爲原發性和繼發性兩種。
(1)原發性營養不良:主要由於食物蛋白質和能源供給和攝入不足，長期不能滿足人體生理需求，發展中國家和經濟落後地區多發生。
(2)繼發性營養不良:多由其他疾病誘發，在歐美等發達國家和長子和大人中發生的營養不良多爲繼發性，常見於吸收不良綜合徵、慢性感染、炎症性疾病和惡性腫瘤等慢性消耗性疾病。食物中缺乏蛋白質，即使熱量足夠也會導致脂肪肝。由於營養不良引起的脂肪肝主要見於兒童多種內分泌代謝性疾病，如皮質醇增多症、甲亢、高尿酸血癥、高脂蛋白血癥、糖尿病高脂血症等，均可引起肝細胞脂肪變性，其中非胰島素依賴性糖尿病與脂肪肝的關係最爲密切。
3。生物因素包括病毒和細菌等病原微生物和寄生蟲，這些病原因主要導致肝細胞變性壞死和炎性細胞浸潤。最近研究發現，部分丙型肝炎病毒、丁型肝炎病毒感染可分別引起大泡性和小泡性肝細胞脂肪變性。肺結核、敗血症等慢性細菌感染性疾病也可能因營養不良、缺氧、細胞毒素損害等因素引起肝細胞脂肪變性。另外，各種病毒性肝炎的恢復期和慢性病毒感染可以誘發肥胖性脂肪肝。
4。遺傳因素主要通過遺傳物質基因的突變和染色體的畸變直接生病。在肝臟中，它們主要引起先天性代謝性肝病，其中肝豆狀核變性、半乳糖血症、糖原累積病、果糖耐受不良等遺傳病可引起大泡性脂肪肝，而尿素循環酶先天性缺陷、線粒體脂肪酸氧化遺傳缺陷等則可引起小泡性脂肪肝。另外，一些家庭的人有肥胖、I型糖尿病、原發性高脂血症等疾病素質，這種現象被稱爲遺傳易感性。
祛除病因脂肪肝是由多種病因引起的獲得性疾病，尋找病因和積極控制原發對脂肪肝的防治至關重要。
長期酗酒、酒精中毒引起的酒精性脂肪肝患者應戒酒。戒酒對單純性酒精性脂肪肝絕對有效，肝內脂肪沉積一般在戒酒幾周或幾個月內徹底消退；營養不良脂肪肝者應合理強化營養；小腸改道手術引起的脂肪肝，應重新手術相吻合，使腸道恢復到改道前的狀況，並補充必要的氨基酸；肥胖和糖尿病性脂肪肝治療的關鍵在於有效控制體重和血糖；腸胃外營養引起的脂肪肝應避免過高的熱量和過多的脂肪乳劑輸注，儘可能早開放經口或經管飲食；慢性肝炎患者不管病情是不是必要的，長期過高的熱量攝入和過多的強調休息期內脂肪肝內消退，因此儘量避免妊娠後的損害。
