化學劑對胎兒的損害是僅次輻射線的自然環境因素。這種化學劑充斥着在工業生產與空氣污染中，懷孕的女人一般 在不經意間中遭受傷害而不自知。這種會危害到生孕及胎兒的化學劑主要是一些會毀壞內分泌失調的化學劑、重金屬超標、有機溶液及殺蟲劑等。
依據英國一項統計分析強調，大概有17%的孕媽媽會在工作場所觸碰到導致胎兒畸型的化學劑，且最少有51種人造的化學劑證實會導致胎兒畸型。這種會毀壞內分泌失調的化學劑歸屬於雄性荷爾蒙的類似物，會佔有雄性荷爾蒙的接收器或引起異常的雄性荷爾蒙反映。比如有一些食材之中帶有人造的雌性荷爾蒙和男性素，這種都非常容易導致胎兒生殖器官生長髮育的異常。
DDT殺蟲劑儘管是一種酚類化合物，但其中就帶有雌性荷爾蒙的功效，證實會針對飛禽以及它野生動植物導致不孕症。如今DDT雖不用，可是之前用的DDT會存有大家的自然環境中，比如殘餘在大家的土壤層中而通過食材進到孕媽媽身體，針對胎兒的危害包含低休重與小腦症。
有一些重金屬超標會跑到土地資源裏而進到食物網中，比如通過土壤層及水，讓魚遭受環境污染，而人吃完魚以後就會感柒，比如以前以前暴發有機汞通過魚而對身體損害的新聞熱點。太多的汞會導致神經系統的損害，會讓胎兒造成腦性麻木及小腦症。
現在有很多人用鉛作爲染劑，報刊中也帶鉛，很多企業將鉛丟掉以後，就會走掉土壤層裏。依據統計分析，美國有52%的家中含鉛量都超出可容許的範疇。若是鉛過多會導致胎兒的身亡及其智能化生長髮育的阻礙。一般 孕媽媽血中濃度值超出1ml10mg，就會對胎兒導致損害。
鎘也常被用於當做繪畫的原料，因而染劑加工廠排出污水導致的環境污染也時有所聞，比如中國臺灣以前產生過的鎘米事情，在小動物上鎘會導致胎兒的脣齶裂、上顎裂、無腦兒、肺臟的發育不良或神經系統的損害等難題，在人們則尚需確認。
多環芳烴(PCB)也是一例，它是常被用在電子器件塑膠製品或黏着劑的一項原料，儘管如今已不用，但在自然環境中仍易殘留，因而在魚種、豬、牛羊肉或奶製品中很有可能存有，而在攝入過多後會導致不孕症、胎兒發育不全、胎兒停育或智能化生長髮育不夠，孕媽媽自身也是有長期性的臉部痤瘡和色素沉澱及甲狀腺素出現異常。
有機溶液，比如二甲苯會導致胎兒腿部發育不全。這在日常日常生活觸碰到的物件如甲油、啫喱水、修正液、漆料、松香油等都常具備這種成份。戴奧辛會導致子宮壁過多增長，減少生育功能及其提升孑宮內膜異位症的概率。殺蟲劑非常容易導致卵巢欠佳、胎兒臍膨出及先天心臟疾病。因而孕媽媽在工作中或家居有觸碰到園藝花卉時，要尤其提升警惕，殺蟲劑、土壤層、洗潔劑等物件都是有很有可能導致危害。
