平時我們聽得最多是轉基因大豆油對我們身體的危害，不過，很多事物都有兩面性，轉基因大豆油也是有好處的。
對消費者來說，轉基因大豆油的最大好處是價格便宜。我國的大豆出產率低，所以現在市面上的大豆大部分是從巴西或美國進口的，而進口大豆100%是轉基因大豆，其出油率在20%-21%之間，而國產的大豆出油率只有17%，價格卻比進口的貴，因此多數廠家都會使用進口大豆做原料提煉大豆油來降低成本。
而我國的大部分消費者還是對價格比較敏感的，便宜的大豆油讓普通階層也能吃上衛生的食用油，避免去購買可能不符合安全生產規範的散裝油甚至地溝油，從一定層面上保證了食品安全。
對於環保主義者來說，多吃轉基因大豆油對於改善地球環境是有益的。事實上，轉基因大豆的研製是爲了配合草甘膦除草劑的使用。草甘膦在除草的過程中能除掉很多種雜草，不過也會殺害作物，所以難以投入使用。通過轉基因的方法，讓大豆產生更多能抵抗甘草膦的EPSPS合成酶，所以，農民在種植大豆期間，只需使用草甘膦除草劑就能清除所有雜草又不會傷害到大豆，減少了農藥的濫用，從而保護了環境。
