不知爲何，過去大家一直認爲喝咖啡不好，有損健康。但現在這種看法已經完全被顛覆了，大量的、越來越多的證據表明，喝咖啡對健康有益，包括減少2型糖尿病、心血管疾病和神經障礙疾病等的發生率。爲此，2015年版《美國居民膳食指南》強調，每天3~5杯咖啡(每杯約240毫升，以咖啡因計不超過400毫克/天)是健康飲食的一部分。
【注意，下文中“有20項研究”、“有36項研究”、“有48項研究”……都有出處，並非隨便寫的，具體文獻見中國營養學會編著《食物與健康—科學證據共識》，人民衛生出版社2016年4月出版】
喝咖啡降低總死亡率
有20項研究(其中日本3項、歐洲8項、美國9項)調查了97萬餘人，發現喝咖啡降低總死亡率(排除年齡、吸菸、飲酒和肥胖等相關因素)。咖啡降低總死亡率的作用似乎對亞洲人作用更強，而且沒有性別差異。其中一項最重要的研究2012發表在新英格蘭醫學雜誌上，對40餘萬咖啡飲用者長達13年的隨訪表明，飲用咖啡可降低10%左右總死亡率。
喝咖啡降低心血管疾病風險
有36項研究調查了約128萬人(覆蓋美洲、歐洲和亞洲)，發現飲用咖啡可以降低冠心病和腦卒中等心血管疾病風險，其作用似乎在每天喝3~5杯時最爲明顯。
之前已經知道咖啡因可以使血壓短暫性升高(持續2、3小時)，但長期攝入咖啡並不會增加患高血壓的風險，反倒對血壓、血管等有益。分析原因是咖啡裏的咖啡因升壓作用微弱，並可被其對心血管的保護作用所中和，比如咖啡豆含有的抗氧化物質可以降低血脂。喝咖啡可以降低未來10年內冠心病的風險，甚至還能預防心衰。而且，喝咖啡與心律失常沒有關係，心律失常者也可以喝咖啡。
喝咖啡預防糖尿病
有48項研究調查了148萬多人(包括美洲、歐洲和亞洲等國家人羣)，發現喝咖啡可降低糖尿病發生風險，且作用顯著。與不喝咖啡者相比，每天飲用咖啡可以降低糖尿病風險25%~31%，而且這種作用與地區、性別和種族無關。比如其中一項研究調查了2300多位臺灣人，也得出了類似結論。這些研究發現，經常飲用咖啡具有改善糖代謝，胰島素分泌的作用，並顯着降低糖尿病風險。有專家分析這可能與咖啡含有的“綠原酸”有關。
咖啡可能也會降低腫瘤風險
有10項研究(涉及約20萬參與者，包括9千例前列腺癌)表明，規律引用咖啡降低患前列腺癌風險。
有37項研究(涉及約97萬參與者，包括約6萬例乳腺癌)表明，整體而言喝咖啡與乳腺癌無關，但可以降低絕經後女性患乳腺癌風險，也可以降低攜帶乳腺癌基因(BRCA1，乳腺癌1號基因)者患乳腺癌的風險。
有10項研究(涉及約51萬參與者，包括4484例子宮內膜癌)表明，喝咖啡降低子宮內膜癌風險。
有41項研究(涉及97萬人，包括中國人)表明，與不喝或極少喝咖啡者比，喝咖啡較多者患結腸癌風險降低，對直腸癌影響不大。有研究對60多萬新加坡中國人隨訪12年，發現每天喝2杯或更多咖啡者可以降低吸菸中老年人患結腸癌風險，且無性別差異。
此外，還有14項研究發現喝咖啡降低食管癌風險;有2項研究發現喝咖啡降低肝癌風險;有21項研究顯示喝咖啡與膀胱癌無關。
當然，因爲腫瘤發生發展的原因非常複雜，目前可能還不能把推薦喝咖啡作爲預防腫瘤的方法，但這些研究至少表明，喝咖啡對預防腫瘤是有益無害的。
喝咖啡的其他健康益處
喝咖啡有利於認知功能。2012年的研究報告指出，對有輕度認知功能障礙的患者，喝咖啡有助於避免在接下來的2-4年內發展爲老年癡呆症。2015年的一項研究報告說，咖啡因攝入有助於增強記憶力。另外，咖啡對帕金森患者的神經保護作用是公認的。
喝咖啡也可能有利於心理健康。2011年的研究表明，每天喝2到3杯咖啡的婦女較那些每週喝不到一杯咖啡的婦女相比，其發生抑鬱症的風險可降低15%。而每天喝四杯以上抑鬱症發病率可降低20%。
喝咖啡可以保護肝臟。2012年的研究報道顯示，咖啡攝入量與降低非酒精性脂肪肝病(NAFLD)風險有關，2014年的一項研究發現，咖啡可降低非酒精性脂肪肝的發生，同時防止這類患者發生肝臟纖維化。
喝咖啡的弊端
有15項研究(涉及25萬多人)發現，每天飲用咖啡超過3、5杯會增加女性骨折風險，且喝咖啡越多則骨折風險越大。不過，男性似乎相反，骨折風險反而降低。這說明，鈣的營養狀況或骨骼健康程度是影響咖啡益處的重要因素。換言之，喝咖啡要首先保證鈣營養充足。
喝咖啡會導致血壓短暫性升高。引起或加重焦慮，失眠，震顫和青光眼的風險。
