非典型肺炎令人聞風喪膽，但非典不一定就是無藥可救必死無疑。病程進入2～3周後，治療得當，可發熱漸退，其他症狀與體徵減輕乃至消失。肺部炎症改變的吸收和恢復則較爲緩慢，體溫正常後仍需2周左右才能完全吸收恢復正常。以下爲一般治療方法。
1、一般治療；
（1）臥牀休息；
（2）避免劇烈咳嗽，咳嗽劇烈者給予鎮咳；咳痰者給予祛痰藥；
（3）發熱超過38.5度者，可使用解熱鎮痛藥，兒童忌用阿司匹林；或給予冰敷、酒精擦浴等物理降溫；
（4）有心、肝、腎等器官功能損害，應該做相應的處理。
2、氧療——出現氣促應給予持續鼻導管或面罩吸氧；
（1）鼻導管或鼻塞給氧常用而簡單的方法，適用於低濃度給氧，患者易於接受；
（2）面罩給氧面罩上有調節裝置，可調節罩內氧濃度，不需溼化，耗氧量較少；
（3）氣管插管或切開經插管或切開處射流給氧效果好，且有利於呼吸道分泌物的排出和保持氣道通暢；
（4）呼吸機給氧是最佳的氧療途徑和方法，常用於重症患者的搶救。
3、糖皮質激素的應用——應用糖皮質激素的治療應有以下指徵之一；
（1）有嚴重中毒症狀，高熱持續3天不退；
（2）48h內肺部陰影面積擴大超過50%；
（3）有急性肺損傷；
4、抗菌藥物的應用；
爲了防治細菌感染，應使用抗生素覆蓋社區獲得性肺炎的常見病原體，臨牀上可選用大環內酯類（如阿奇黴素等）、氟喹諾酮類、β-內酰胺類、四環素類等，如果痰培養或臨牀上提示有耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染或耐青黴素肺炎鏈球菌感染，可選用（去甲）萬古黴素等。
5.抗病毒藥物；
至今尚無肯定有效抗病毒藥物治療，治療時可選擇試用抗病毒藥物。
6.重症病例的處理；
（1）加強對患者的動態監護：儘可能收入重症監護病房；
（2）使用無創傷正壓機械通氣；
（3）若氧飽和度改善不滿意，應及時進行有創正壓機械通氣治療。
