新生兒的一些器官和組織還沒有完全發育成熟，新陳代謝旺盛，血液循環需要的時間短，吸收、排泄都比較快，抵抗力弱，所以容易生病，但新生兒對藥物的反應敏感性強，因此給新生兒用藥應慎之又慎。
1、避免使用解熱鎮痛劑類的藥物等。因爲這類藥物可引起新生兒青紫症、貧血，以及肚臍出血、吐血、便血等。如果非萬不得已必須使用時，也應注意劑量切忌不可過大，用藥時間不可過長。
2、注意某些抗生素的使用，都容易引起黃斑牙;氯黴素可抑制骨髓的造血功能，可使服藥的新生兒發生再生障礙性貧血和粒細胞缺乏症;新黴素可引起新生兒高膽紅素血癥和耳聾。
3、儘量避免用藥或使用中藥製劑，避免其生病。另外，在新生兒發熱、炎症時儘量選用一些中成藥沖劑和糖漿製劑服用。
新生兒用藥應注意以下幾方面的問題:
一、及早用藥
新生兒抗病力弱，往往起病較急，病情變化較快，而疾病的臨牀表現常不典型、不易被察覺。因此，必須善於觀察病情，及早診斷，及時正確用藥。如常見的新生兒敗血症，常有發燒及白血球升高等現象，而僅表現出神情發呆、吃奶不香，如不能及時早治，正確用藥，就會延誤病情。
二、慎重用藥
新生兒，尤其是未成熟兒，肝腎功能發育不完善，系統活力欠佳，用藥時如不仔細斟酌，精確計算，常會引起嚴重的中毒反應。如用氯黴素後可引起灰色綜合徵;磺胺類藥及大量維生素K等可引起新生兒高膽紅素血癥，甚至核黃疸;冬眠靈可引起高鐵血紅蛋白血癥;大劑量使用鏈黴素，不僅可使聽神經受到損害，而且還會引起昏迷，導致死亡。
三、外用藥物應警惕中黴反應
普普通通的鼻眼淨、皮炎激素軟膏、新黴素油膏等，都可引起嚴重副反應。常用鼻眼淨可能引起昏迷、呼吸暫停、肌張力減低等，治療皮膚病用的皮炎激素軟膏，對新生兒大面積使用，可引起全身性水腫。這主要是由於新生兒皮膚薄嫩，皮膚黏膜面積相對大，有很強的呼吸作用，當有炎症或破損時，對藥物的吸收作用更強更快。因此不能把成人用的外用藥隨便用於嬰兒。
四、注意用藥途徑及次數
新生兒、未成熟兒、重危病兒不宜給丸、片劑型藥。因此，片劑均應研磨成粉或調配成液體，用滴管慢慢喂服，病情重者儘可能靜脈點滴給藥。因爲新生兒新陳代謝旺盛，對藥物的吸收快，排泄亦快，給藥時應根據病情，按體重或體表面積計算出每日應給藥物的總量，把總量分爲三四次。
另外，應注意藥物分配及副作用，待病癒後，再用藥一二天，鞏固療效。
