首先是測量工具，基礎體溫計和一般體溫計是不一樣的，基礎體溫計的刻度較密，基礎體溫計的靈敏度也相對較高，一般高低溫的分界是36.7度。測量的結果會更加精確。有的人會用水銀溫度計來測量基礎體溫，就容易出現誤差。
然後是測量方法，測量基礎體溫要注意正確的測量方法，如果使用不當是會導致誤差的出現，測量結果也就沒那麼準確了，一般來說，要保持6個小時以上的睡眠時間，醒來後不說話，不運動，用基礎體溫計放入口腔進行測量，這樣的測量結果纔會比較準確。
最後是身體狀況，每個人的基礎體溫是不一樣的，雖然正常情況下基礎體溫的變化範圍是在0.3-0.5℃內，但是堅持長期測量（3個月以上）出的結果會更準確。基礎體溫可以用作計算排卵期的參考方法，但也可以同時用其他方法來推算排卵期。另外感冒、發燒、失眠也會影響基礎體溫，所以在測量時要記得標註一下。
