嚴重便祕的原因包括年齡因素、激素改變、腸道病變。
1.年齡因素：嚴重便祕多發生於老年人羣體，隨着年齡增加後，進食量和運動量都會明顯減少，進而會影響到胃腸道消化液的分泌。同時，腸管的蠕動性以及腹腔、盆底肌肉的活動性，都會隨着年齡增長而減弱。當直腸敏感性下降後，食物就可能在腸內停留時間過長，最終就可能引起便祕。另外，部分老年人因阿爾茨海默病和抑鬱症而失去排便反射功能，也會導致便祕。
2.激素改變：妊娠期間也容易出現嚴重便祕，特別是在妊娠後期時，孕婦體內會分泌大量的黃體酮，會引起胃腸道肌張力減弱，導致腸道蠕動變慢，進而引起孕期便祕。其次，妊娠晚期時子宮壓力會增加，壓迫到盆底肌肉後，也會影響直腸蠕動，從而導致便祕發生。
3.腸道病變：如果腸道部位出現病變，比如炎症性腸病、直腸脫垂、腸腫瘤、疝氣等疾病，也會誘發功能性出口梗阻，從而引起排便功能障礙。
