固元膏的保存主要分爲短期保存和長期保存，同時也要看食用的季節。一般夏季，天氣炎熱，製作固元膏的量又不大，切成小塊，放冰箱冷藏即可。相反，如果是冬季製作少量的固元膏，直接常溫下保存即可。當然，如果製作固元膏的量偏大，無法短時間內食用完畢，將採取小瓶分裝的辦法。找到合適乾淨的瓶子，將固元膏分別裝入，並密封好，放入冰箱內冷藏或冷凍，依據自己想要食用的時間來決定。想吃的時候，就用勺子盛出一些來吃即可。
